VAT申报使用货代的VAT税号进行清关的风险有：
1.多个客户在清关时使用相同的VAT税号，若被查出借用他人的VAT或VAT号无效，货物可能被扣留而无法清关；
2.若做头程清关的VAT与客户销售平台关联的VAT不一致，则头程清关缴纳的VAT税费在VAT销项税申报环节中不能抵扣，即使当期销售税额小于进口所缴的VAT金额，也无法实现退税。
3.无法证明货物的来源。